misopy

Software screenshot:
misopy
Podrobnosti Software:
Verze: 0.4.9
Datum uploadu: 20 Feb 15
Vývojka: Yarden Katz
Licence: Volný
Popularita: 7

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

MISO (směs izoforem) je pravděpodobnostní framework napsaný v Pythonu, který quantitates hladinu exprese & nbsp; z alternativnímu sestřihu genů z RNA Seq dat, a identifikuje rozdílně regulované izoformy nebo exony přes vzorků.
Modelováním generativní proces, který čte jsou vyrobeny z izoforem v RNA-Seq, model MISO používá Bayesian závěr pro výpočet pravděpodobnosti, že čtení pochází z určitého izoformy.
MISO používá odvozený přiřazení čte izoforem pro kvantifikaci abundances základní sady alternativních mRNA izoforem. Intervaly spolehlivosti nad odhady mohou být získány, který kvantifikovat spolehlivost odhadů.
Pro MISO manuál a dokumentaci naleznete http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/

Požadavky na :.

  • Python

Podobný software

VULCAN
VULCAN

20 Feb 15

GDIS
GDIS

3 Jun 15

Seal
Seal

14 Apr 15

LSim
LSim

2 Jun 15

Komentáře k misopy

Komentáře nebyl nalezen
Přidat komentář
Zapnout obrázky!