Staden Package

Software screenshot:
Staden Package
Podrobnosti Software:
Verze: 1.7.0 / 2.0.0 Beta 8
Datum uploadu: 12 May 15
Licence: Volný
Popularita: 8

Rating: 2.0/5 (Total Votes: 1)

Staden Package je plně rozvinutý soubor sestavy sekvence DNA (Gap4), editaci a analytických nástrojů (Spin) pro Unix, Linux, MacOSX a MS Windows.
Na Gap4 frontě došlo k několika menší spojování související
zlepšení v tom, jak skóre připojí v Najít Vnitřní Spoje a
funkčnost tlačítka align v Přidejte editoru.
I následky pro gap4 jsou různé změny io_lib (
Knihovna pro všechny I / O různých formátů souboru trasování). S přidáním
nového hash_exp programem, který nyní umožňuje pro experiment soubory, které budou
spojení společně a indexovány. Seznam názvů souborů experiment
by měl být dodáván do stil gap4, ale za předpokladu, že EXP_PATH prostředí
proměnná byl nastaven správně gap4 budou moci načíst jednotlivé
sekvence ven z zřetězený experimentu souboru
archiv. Vylepšení uživatelského rozhraní pro to ještě musí být
provedena.
454 SFF archivy jsou nyní lépe podporovány. V defsult 454 Indexy
nyní pracovat, i když je program hash_sff může být použit pro poskytnutí
Alternativní strategií indexování (případně rychlejší v některých případech).
Gap4 a Trev mají také další trasování styl zobrazení na stopy, které
mají 1 vzorek skenování (x4 kanály) na základní výzvy. V tomto případě to může
také čerpat 4 hodnoty spolehlivosti namísto 1 za základny. Tyto schopnosti
umožní lepší začlenění Solexa stopy při snadněji
k dispozici.
Plus samozřejmě obvyklý mix oprav chyb a drobné vychytávky. Viz
plná log změn Podrobnosti (přes místě SourceForge).
Jiné pozoruhodné změny
Gap4

Podobný software

AHREA
AHREA

11 May 15

biotools
biotools

20 Feb 15

CaPSID
CaPSID

20 Feb 15

CWC Simulator
CWC Simulator

11 May 15

Komentáře k Staden Package

Komentáře nebyl nalezen
Přidat komentář
Zapnout obrázky!