GenoSuite je rámec vyvinutý pro proteogenomic analýzu. Strategie založené FDRScore se používá k integraci výsledky z více vyhledávacích algoritmů. Prokaryotická Proteogenomic Tool (PPT) je vyvíjen jako součást rámce GenoSuite. PPT je pro nalezení nové překlady v prokaryotických genomů a je závislá na proteomika údaje hmotnostní spektrometrie a pro související sekvence genomu. Funkce zahrnují nakonfigurován pro 4 open source algoritmů provádět databáze vyhledávání pro identifikaci peptidů a jakékoliv kombinaci 4, algoritmus může být vybrána, uvádí seznam specifických peptidů genom vyhledávání (román peptidy), spektrální zápasy mohou být zobrazeny pro posouzení kvality, uvádí seznam Nové proteiny a změny ve stávajících proteinů anotací a vizuální genomické kontextu nových peptidů může být také generovány.
Komentáře nebyl nalezen