MACS2 je model založený analytický nástroj pro chip-Seq dat.
Se zlepšením sekvencování technik, chromatin immunoprecipitation následuje vysokou propustnost sekvenování (chip-Seq) je stále oblíbenější pro studium celogenomových protein-DNA interakce. Chcete-li řešit nedostatek výkonném čipu-Seq metody analýzy, představujeme nový algoritmus, s názvem Model-based Analysis of chip-SEQ (MACS), k identifikaci Přepis faktor vazebná místa. MACS zachycuje vliv složitosti genomu zhodnotit význam obohacených čip regionů, a MACS zlepšuje prostorové rozlišení vazebná místa prostřednictvím sdružování informací jak sekvenční tag poloze a orientaci. . MACS lze snadno použít pro čipové Seq údaje sám, nebo s kontrolním vzorkem s nárůstem specifičnosti
Požadavky na :
- Python
Komentáře nebyl nalezen