QuasiRecomb

QuasiRecomb je lehká aplikace, která běží v příkazovém konzole, napodobující Markov model pro generování virové kvazidruhů. Popisuje tvorbu virových kvazidruhů a způsobu jeho parametry odvodit na základě analýzy dat sekvenování nové generace. Tento model je ověřen v simulovaných dat, ukazuje výhodu výslovně při procesu rekombinace v úvahu, a testovány tak, že se čte získané z experimentálních vzorků HIV. Nabízí realizaci EM algoritmu najít maximální odhady posteriori parametrů modelu a způsobu odhadu rozložení virových kmenů v kvazidruhů

Požadavky na :.

Java