Musí mít Bioinformatika Pro Linux
ProteinShop je interaktivní nástroj pro manipulaci s proteinové struktury. To byl navržen tak, aby rychle vytvořit sadu konfigurací proteinu pomocí lidského poznání a intuice. Tyto konfigurace mohou být podrobeny lokální nebo globální optimalizaci. Ačkoli...
pyNetConv je knihovna Python vytvořená s cílem pomoci přeměně některých formátů souborů sítě.Od verze 0.6, pyNetConv je schopen čtení / zápis (a převést z / do) následující formáty...
Pysam je Python modul pro čtení a manipulaci Samfiles. & Nbsp; Je to lehký obal z samtools C-API.Stručný návod k obsluze je zde. Podrobnější dokumentace je k dispozici zde.Dotazy a připomínky jsou velmi vítány a měly by být zaslány do skupiny uživatelů...
PySCeS je projekt vyvinutý Triple-J skupiny pro molekulární buněčné fyziologie. & Nbsp; s cílem vyzkoušet model a pochopení složitých procesů a systémů, které tvoří živé buňky Vlastnosti :. textový popis modelu jazyk statika modul. integrátoři za...
reciprocal_smallest_distance je po dvou orthology algoritmus, který používá globální srovnání sekvencí a maximum pravděpodobnosti evoluční vzdálenost mezi sekvencemi přesně detekuje ortology mezi genomů. Instalace Z tarballu Stáhněte si a untar nejnovější...
Planner RFLP je nástroj, který pomáhá plánovat RFLP experiment: Konstatuje restrikčních enzymů, které jdou sadu homologu sekvencí DNA různými způsoby a simuluje výsledný gel- elektroforézy obraz. Program vám pomůže najít klíčové restrikčních enzymů, které...
Seal je Python modul, který poskytuje srovnání sekvencí na Hadoop.Seal je o MapReduce aplikace pro biologickou sekvenčního. To běží na Hadoop (http://hadoop.apache.org) přes Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), což je Python MapReduce a HDFS API pro...
seriesoftubes je prodloužená potrubí pro Solexa chip-násl dat.Dokumentace balení
Požadavky na :
...
budování systémů, jako je make jsou často používány k vytváření složité pracovní postupy, např V bioinformatiky. & nbsp; snakemake si klade za cíl snížit složitost vytváření pracovních postupů tím, že poskytuje čisté a moderní jednotlivé oblasti...
SSuMMo je knihovna funkcí navržených kolem opakované použití HMMER přiřadit sekvencí taxonů. & Nbsp; Výsledky jsou velmi komentovaných stromy vykazující druh / distribuci rod v této komunitě.Programy součástí se zdrojovým kódem jsou nástroje pro: --...
