Arabidopsis Motif Scanner (AMS) je Windows aplikace, která běží na lokálních počítačích. Byl vyvinut k vytvoření genové sítě určením polohy cis-regulační elementy v Arabidopsis thaliana modelové rostliny a tím, že poskytuje jednoduché rozhraní k určení a vyhodnocení genové vztahy. Jejím hlavním inovativní funkce je spojit prvku pozice cis-regulační, NGS a DNA čipů Arrays expresní data, Arabidopsis anotace a genových interakcí pro identifikaci genových sítí regulovaných transkripčních faktorů. Ve studiích zaměřených na funkci transkripčních faktorů, software využívá data, výraz a závazné motivy stránek v usměrňující genových regionů předvídat přímé cílových genů. Navíc AMS využívá údaje o DNA-protein a protein-protein interakce s cílem usnadnit identifikaci metabolických drah regulované transkripční faktor zájmu.
Komentáře nebyl nalezen