Ascalaph Designer

Ascalaph Designer je univerzální program pro molekulární dynamické simulace. V rámci jednotného grafického prostředí jsou reprezentovány jako jejich vlastní realizace molekulární dynamiky, jakož i metody klasické a kvantové mechaniky populárních programů. Funkce zahrnují molekulární slovy: více oken, dva fotoaparáty za modelu, CPK, Wire rám, Stick, kuličkové a Stick, a CPK wire frame styly, Molekulární model objektu: křišťálové stavitel, řetěz stavitel, kreslení myší, molekulární úpravy geometrie, předběžný optimalizace , kvantová optimalizace, a střety odstranění, optimalizace molekulární geometrie s metodami sdružených gradientů, molekulární dynamiky: v různém čase integrační krok, integrace čtvrtého řádu, výpočty superpočítačů s pomocí MDynaMix, pružný model SPC vody a implicitní modelu vodou, a kvantové chemie s podporou z CP2K a PC GAMESS / Firefly:. energie, optimalizaci molekulární geometrie a potenciál odvozené náklady