bint

bint je software byl napsán za účelem získání podmnožiny dat intenzity z genotypu testů. & Nbsp; buď do X & Y intenzity pro vytvoření klastru pozemků nebo se přihlásit poměr R a B alela frekvence pro detekci CNV.
Extrakce dat pro jednotlivé SNP / CNV značky nebo jednotlivých vzorků byla pomalá grep / awk'ing textové soubory exportované z genotypu běhu (např Illumina závěrečná zpráva soubory).
Bint převede textovou reprezentaci intenzita float dat k do indexované binárního souboru IEEE754 pro rychlou extrakci podmnožin dat. Teoreticky Bint by mohly být použity pro všechny velké tabulky dat hotovost.