nástroj příkazového řádku pro porovnání čárkou datových souborů pomocí relativní rozdíly určit nejvíce podobné konformace. Compsortall porovnává soubory dat pomocí relativní rozdíl, počítá skóre podobnosti, seřadí výsledky ven z jádra ve vzestupném pořadí (nižší hodnoty představují větší podobnost), uloží všechny výsledky v textovém souboru. Datové soubory vytvořené uživatelem, musí být odděleny čárkou textové soubory. Každý soubor představuje unikátní molekulu. Každý řádek v souboru představuje jedinečný konformaci molekuly. První sloupec v souboru dat musí být štítek jedinečné konformaci reprezentované řádku. Zbytek sloupců jsou číselné popisovače, jako je například měření vzdálenosti prostor. Řádky jsou porovnány combinatorially mezi soubory. Popisky v porovnání se zřetězeny a uloží se skóre pro sadu řádků. To poskytuje způsob, jak identifikovat konformace, které produkují dané skóre podobnosti.
Budoucí práce zahrnuje:
přidávání
GUI rozhraní
vysílání papír na mém 3D farmakoforu modelování algoritmů
Paralelní verze využívající MPI
Co je nového v této verzi:
- Změnil výstup na obrazovku pro posledního sloučení a psát cyklus více přesně odráží počet řádků sloučeny a v písemné formě.
- Pevná pravopisná chyba.
- Mírné změny ve zdrojovém kódu pro přidávání poznámek a názvy proměnných aby se zlepšila čitelnost
Požadavky na :.
Mac OS X 10.3
Komentáře nebyl nalezen