Gabedit

Gabedit je grafické uživatelské rozhraní pro Gaussian, Molcas, Molpro a MPQC výpočetní chemie balíčků.
 
 Gabedit obsahuje grafické zařízení pro generování klíčových slov a možností, specifikace molekuly a Ther vstupní sekce i pro ty pokročilé typy výpočtů Gabedit obsahuje pokročilé Molecule Builder.
 
 Můžete ji použít k rychle nastínit v molekulách a zkoumat je ve třech rozměrech. Můžete si vytvořit molekuly po atomu, prsten, skupina, aminokyseliny a nukleosidů. Můžete si také přečíst geometrii ze souboru. Většina hlavních formátů molekulární souborů jsou podporovány.
 
 Gabedit obsahuje okno Nastavení Výpočet Gaussian, Molcas, Molpro a MPQC, který vám umožní nastavit Gaussian, Molcas, Molpro a MPQC pracovních míst v jednoduché a přímočaré způsobem.
 
 Gabedit zahrnuje textový editor pro editaci Molcas, Molpro, Gaussian a MPQC vstupní soubory.
 
 Gabedit může graficky zobrazit různé Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC a (částečně) výsledky výpočtů ADF, včetně následujících:
 
 ย ท Molekulární orbitaly.
 ย ท Povrchy z elektronové hustoty, elektrostatický potenciál, NMR hustota stínění, a dalších vlastností.
 ย ท Povrchy mohou být zobrazeny v pevných, průsvitné a drátěných režimy pletiva.
 ย ท Povrchy mohou být barevné samostatným majetku.
 ย ท Contours (barevně označených).
 ย ท Planes (barevně označených).
 ย ท Dipole
 ย ท XYZ osy a hlavní osy molekuly.
 ย ท Animace běžných způsobů, které odpovídají vibrační frekvence.
 ย ท Animace rotace geometrie, povrchu, dipól, xyz a hlavních os molekuly.
 ย ท Animace obrysy.
 ย ท Animace barevně označených letadel.
 
 Gabedit můžete zobrazit IR a Ramanova spektra vypočítána. Gabedit může generovat povray soubor geometrií (atomy + dluhopisy, včetně vazby vodík je), povrchy (včetně barevně označených ploch), obrysů, barevně označených rovin.
 
 Gabedit můžete uložit obrázek PPM, BMP, JPEG () a ve formátu PS. Gabedit mohou generovat automaticky sérii snímků pro animaci (vibrace, geometrie konvergence, rotace, kontury, barevně označených rovin)

Co je nového v této verzi:

• Drobné chyby byly opraveny.
• NWChem je nyní podporována.
• Na nativní Windows hry je nyní podporována.

Co je nového ve verzi 2.3.5:.

• Drobné chyby byly opraveny
• Atomy mohou být stanoveny v průběhu molekulární simulace dynamiky.
• Migrace z Káhiry do OpenGL pro kreslení okna geometrie.
• Migrace z gtkglarea do GtkGLExt.
• Paralelizace pomocí OpenMP.

Co je nového ve verzi 2.3.0:.

• Drobné chyby byly opraveny
• Uživatel může číst orbitaly, geometrii a normálním režimem ze fchk Gaussova souboru.
• Jeden může přečíst orbitaly z nového formátu MOPAC aux souboru (včetně komprimovaném formátu).
• Několik nových možností v XYPlot a ContoursPlot oken (vložit text, linka, šíp, obrázky, nová témata ...).
• Délky vazba může být stanovena v průběhu simulace MD.
• Částečné optimalizace je nyní možné s MM potenciálem.
• Implementace nástroje předvídat masy a abundances izotopů pro danou molekulu. Zavedení nástroje pro výpočet elektrofilního, nukleofilní a radikální vnímavosti pro molekulu.

Co je nového ve verzi 2.2.0:

• Drobné chyby byly opraveny
• Všechny geometrické změny lze vrátit zpět a přepracován pomocí Undo a Redo (U / U nebo Ctrl Z / Ctrl y)
• Uživatel má úplnou kontrolu nad dluhopisy zobrazených ve výkresu.
• nákres molekuly atomu vodíku byly zjednodušeny.
• nákres molekuly fragmentu fragmentu byly zjednodušeny.
• Gabedit přečíst connectivities z gabedit, Hin, PDB, mol2 a MOL souborů.
• Uživatel může nastavit hodnotu vzdálenosti, úhlu dluhopisů a dihedral úhlu.
• molekulární dynamika konformační vyhledávání je realizován pomocí MM potenciál (oranžová 99).
• molekulární dynamiky konformační vyhledávání je realizováno pomocí Semi-empirická metoda (z otevřených MOPAC nebo PCGamess).
• Migrace z kreslicích funkcí GDK do Káhiry:. Cross-zařízení vykreslování pro vektorovou grafiku
• Cairo se nyní používá pro XYplot gabedit widgetu (používané gabedit pro draw spektra).
• Káhira je nyní používán pro okno výkresu geometrie.
• Geometry lze exportovat do formátu EPS, PS, PDF nebo SVG souboru.
• Křivky okna XYplot lze exportovat do formátu EPS, PS, PDF nebo SVG souboru.
• Nový nástroj pro výpočetní vzdálenost mezi 2 body na okno XYPlot. & Quot; Control + shift tlačítko & quot; můžete využít k udělat zoom na okno XYPlot.
• Nová verze PCGamess (světluška) je nyní podporován

Co je nového ve verzi 2.1.13:

• Drobné chyby byly fixe
• molekulární dynamika konformační vyhledávání je realizován pomocí MM potenciál (oranžová 99).
• molekulární dynamiky konformační vyhledávání je realizováno pomocí Semi-Empirický potenciál (pomocí MOPAC nebo PCGAMESS).
• One můžete optimalizovat geometrii interaktivně pomocí MOPAC nebo PCGamess semi-empirickou metodu, z okna Draw Geometrie
• Migrace z kreslicích funkcí GDK do Káhiry: Cross-zařízení vykreslování pro vektorovou grafiku. Cairo se nyní používá pro XYplot gabedit widgetu (používané gabedit pro draw spektra). Káhira je nyní používán pro okno výkresu geometrie.
• Geometry lze exportovat do formátu EPS, PS, PDF nebo SVG souboru. Křivky okna XYplot lze exportovat do formátu EPS, PS, PDF nebo SVG souboru.
• Nový nástroj pro výpočetní vzdálenost mezi 2 body na okno XYPlot. & Quot; Ctrl + levé tlačítko & quot; můžete využít k udělat zoom na okno XYPlot.
• Nová verze PC GAMESS / Firefly je nyní podporována

Požadavky na :

• gtk +