InterMine

InterMine poskytuje přístup rutiny datawarehouses na technologii InterMine.
InterMine je výkonný open source datového skladu systému. Pomocí InterMine, můžete vytvářet databáze biologických dat, ke kterým mají přístup sofistikovanými nástroji web dotazu. Parsery jsou k dispozici pro integraci dat z několika společných biologických formátů a je rámec pro přidávání vlastních dat. InterMine zahrnuje atraktivní, uživatelsky přívětivé webové rozhraní, které pracuje "po vybalení z krabice" a lze je snadno přizpůsobit pro vaše konkrétní potřeby.
Vše InterMine kód je volně k dispozici pod licencí LGPL

Co je nového v této verzi:.

• Spojení do InterMine:
• Existuje několik nových způsobů, jak snadno vytvořit odkaz na vaši dolu. Viz odkazy na podrobnosti.
• formáty JSON webové služby:
• Existuje několik nových výsledky WebService formáty. Spojení jsonobjects, které se objevily v 0.95, nyní máme formáty JSON pro skoro všechno ostatní:
• Výsledky:
• jsonrows - tabulková reprezentace dat s možností metadat
• & quot; jsontable & quot; . - Nádoba formát pro stavbu vestavěných šablon (viz: vnoření tutoriál)
• & quot; počet & quot; a & quot; jsoncount & quot; - Formáty jen za příjem počet dotazu
• webservice meta-data (model a šablony):
• & quot; json & quot; - Snadno rozebratelný verze modelu dat a seznamu dostupných šablon
• Ověření nyní pracuje v Perlu webové služby Klient:
• Uživatelé klienta Perl webové služby nyní mají programový přístup k jejich seznamy a soukromých šablon. Jednoduše poskytují své přihlašovací údaje pro klienta pro přístup k účtu (Vaše údaje jsou přenášeny v zašifrované podobě). Tato funkce bude fungovat ve všech dolech s webservices, a to nejen těch, které na 0,96 a výše.
• Objekt Výsledky s webservice klienty:
• Klienti Perl a Java jsou schopni získat výsledky zpět jako objekty (JSON objekty, nebo v Perlu, nafouknutý až do plné objekty výsledek). To zjednodušuje některé složité otázky zpracování dat, a zacházení s vnější spojení a sbírky.
• Embedded tabulky:
• Nyní můžete nativně vložit tabulky dat z jakéhokoliv dolu s nosnou webové služby do svých webových stránek se JavaScriptu a CSS. Podívejte se na vnoření návod pro demonstraci a úvod k této technice. Ujistěte se, že hrát si s novou knihovnou JavaScript k dispozici na http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Registry:
• Spustili jsme centrální registrační služby pro implementaci InterMine. To nebude sloužit pouze jako & quot; Zlatých stránek & quot ;, který umožňuje návštěvníkům k objevování nových dat, zdrojů, a usnadnit interoperation mezi samotnými doly, ale také podporuje Webservices tím, že poskytuje registr webservice URL a verze. Navštivte registru na http://www.intermine.org/registry, a za pomoc při registraci svůj vlastní důl, naleznete RegisteringYourMine.
• Link přesměrování:
• Můžete přidat vlastnost mít odkazy ve výsledcích stránky redirect k libovolnému URL. Viz LinkRedirects pro více informací.
• Hlavní obsah:
• domácí stránka pro InterMine lze nyní nakonfigurován tak, aby zobrazit různé informace, založené na tom, zda uživatel je nový. Viz HomepageConfig Pokyny pro konfiguraci tohoto chování.
• Nová značka:
• Přidali jsme novou značku: im: admin. Pokud označit šablonu s im: admin, nebude se objeví ve vašem webapp. To je užitečné pro skrývání šablon, které potřebují InterMine je webservices od svých uživatelů. Viz Označení pro seznam všech dostupných značek.
• Seznam nahrávání:
• proces nahrávání seznamu byla lepší.
• Další změny:
• UPDATE - přísnější korekce více testování hypotéz na obohacování na widgety. & Quot; Počet testů & quot; Nyní je počet termínů spojených s referenčním seznamu.
• UPDATE - více užitečné možnosti filtrování obohacování widgety
• NEW - Holm-Bonferroni přidána volba pro obohacování widgety
• UPDATE - nový & quot; smazat & quot; Tlačítko na seznamy straně
• Aktualizace - interakce displayer naloženo přes AJAX, takže nahlásit stránka se načítá rychleji
• FIX - & quot; score & quot; obrazy zobrazující správně na výsledky vyhledávání
• UPDATE - QueryBuilder více interaktivní, výběrem položky v seznamu se dostanete zpět na původní položku po načtení stránky / Obnovit
• UPDATE - přidán odkaz na souhrnných ve výsledcích dotazu, výroba je jednodušší zobrazit odlišné hodnoty
• FIX - login chyba týkající se s malými uživatelským jménem
• FIX - widgetu chyba při prohlížení po exportu widgetu dat
• NEW - šablony dotazy jsou seřazeny podle oblíbenosti, pokud jste přihlášeni, ve kterém případě oni jsou seřazené podle data každý dotaz byl naposledy spuštěn
• Oprava - údaje se neopakuje v & quot; různé & quot; oddíl o zprávě stranách
• Oprava - šablony správně zobrazené na zprávy straně i na podtřídy
• FIX - šablony správně renderování stran stranách
• UPDATE - aktualizovaný BioGRID převodník pro zpracovávání změn v nejnovější datových souborů
• FIX - různé & quot; zlato & quot; téma CSS a obrazy zlepšit a aktualizovat
• FIX - závit bezpečnostní problém řešit v šabloně sledování
• UPDATE - stolní widgety lze skupina atributem, stejně jako třída

Požadavky na :

• Python