LSim

LSim superposes makromolekulární elektronové hustoty a počítá strukturální podobnosti skóre. Jeho výpočty měřítko lineárně s velikostí molekul porovnávané.
Tyto LSim sladění jsou koncepčně nesouvisí s biochemických konstrukčních prvků, a proto jsou objektivní a vhodné pro struktury pouze protein podobnosti studií.
Instalace:
Rozbalte distribuční soubor:
tar -xzvf lsim-linux.tar.gz
Přesunout do adresáře souboru:
CD lsim.1.0.0
Kopírovat, přesunout nebo propojit spustitelného souboru lsim na vhodném místě -a ujistěte se, že lsim je přístupná přes cestu životního prostředí variabilně, např:
cp lsim / usr / local / bin
Nastavte proměnnou LSIMDIR poukázat na zvolené LSim adresáři, např:
setenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0