MultiDendrograms je jednoduchý, ale výkonná aplikace, aby hierarchického shlukování reálných dat, distribuované pod open source licencí. & Nbsp; počínaje vzdáleností (nebo hmotnosti) matrice, MultiDendrograms vypočítává svou dendrogram pomocí nejběžnější aglomerativní hierarchického shlukování algoritmy , umožňuje ladění mnoha grafických parametrů zastoupení, a výsledky mohou být snadno exportovat do souboru. Souhrn údajů o:
- Multiplatformní: vyvinut v jazyce Java, běží ve všech operačních systémech (např Windows, Linux a MacOS).
- Grafické uživatelské rozhraní: výběr dat, hierarchické možnosti clustering, parametry dendrogram reprezentace, navigace přes dendrogramu, odchylka opatření.
- Hierarchického shlukování algoritmy implementované: variabilní skupina Single zvedák, kompletní zvedák, nevážený průměr, vážený průměr, nevážený těžiště, vážený těžiště a spoj mezi-uvnitř.
- Zastoupení parametry: velikost, orientace, etikety, osa, atd
- Úchylka opatření: Cophenetic korelační koeficient, normalizovaného Mean Squared chyb a normalizovaný střední absolutní chyba.
- Export: ultrametric matrix, dendrogramu detaily v textu a Newick formátů stromů.
- Plot: dendrogram obrázek v JPG, PNG a EPS formátů.
MultiDendrograms implementuje proměnná skupina algoritmů k řešení problému než jedinečnost nalezeny ve standardních algoritmů dvojice-skupiny a implementace. Tento problém nastává, když se dva nebo více minimální vzdálenosti mezi různých skupinách jsou stejné během procesu amalgamové. Standardní přístup spočívá ve výběru páru, prolomení vazby mezi vzdáleností, a postupuje stejným způsobem, dokud není dosaženo konečné hierarchická klasifikace. Nicméně, různé clusterings jsou možné v závislosti na použitém kritériu rozbít vazby (obvykle pár je jen vybrané náhodně!).
Proměnná-skupina algoritmy skupina více než dva klastry ve stejnou dobu, kdy se vyskytují vazby, umožnily nárůst grafické znázornění zvané multidendrogram. Jejich hlavní vlastnosti jsou:
- Pokud nejsou žádné vazby, algoritmy proměnná-skupiny dávají stejné výsledky jako ty Dvojice skupiny.
- Vždycky dát jednoznačně určeno řešení.
- V multidendrogram reprezentaci pro výsledky lze výslovně pozorovat vznik vazeb během aglomerativní procesu. Kromě toho, výška jakéhokoli intervalu jaderné syntézy (pásma v programu) označuje stupeň heterogenity uvnitř příslušného klastru
Požadavky na :.
- Java 2 Standard Edition Runtime Environment
Komentáře nebyl nalezen