MultiGeneBlast

Software screenshot:
MultiGeneBlast
Podrobnosti Software:
Verze: 1.1.5
Datum uploadu: 25 Jan 15
Vývojka: MultiGeneBlast
Licence: Volný
Popularita: 17
Velikost: 14051 Kb

Rating: 1.0/5 (Total Votes: 1)

MultiGeneBlast je open source nástroj založený na přeformátování Fasta záhlaví NCBI GenBank záznamů bílkovin, pomocí kterých je možné sledovat jejich zdroj nukleotid a souřadnice. MultiGeneBlast může pomoci při odhalování takových multigenních dílů pro projekty syntetické biologie. Syntetická knihovna operonu může být vytvořen na základě jeho výstupu identifikovat ty operony, jejichž funkce je nejblíže k jednomu požadované uživatelem. Tento nástroj poskytuje příležitosti k identifikaci všech homologní genomové regiony tím, že kombinuje výsledky jednoho BLASTP běží na každého genu, a třídění genomové regiony z každého vstupu GenBank podle počtu hitů, ochrany syntenii a kumulativní Blast bit skóre. Architektura vyhledávání může být provedeno nalézt žádné genomové regiony se Blast zasahuje kteréhokoliv uživatelem specifikované kombinace aminokyselinových sekvencí.

Podporované operační systémy

Podobný software

Physical Chemistry
Physical Chemistry

22 Sep 15

Combi
Combi

2 Apr 18

Oceanlyz
Oceanlyz

14 Aug 18

Spice-SOM
Spice-SOM

9 Aug 16

Komentáře k MultiGeneBlast

Komentáře nebyl nalezen
Přidat komentář
Zapnout obrázky!