CWC Simulator

CWC Simulator je C ++ implementace CWC, se kalkulu pro reprezentaci a simulace biologických systémů. & Nbsp; Po úspěšné instalaci (viz instalace), budete moci spouštět simulace přes CWC modelů, jak je uvedeno v některých příkladech (viz příklady /).
(Command-line) Rozhraní
Jako generické uživatel, měli byste spustit:

-i model.cwc
-O
-t
-s
-n
-c
--qt-práh
-q
-w
Kde:
- je název spustitelného souboru (výchozí: scwc);
& Nbsp; - model.cwc je vstup CWC programu (viz příklady);
& Nbsp; - statistika je předpona výstupních-soubory;
& Nbsp; - <čas> je simulace, lhůta;
& Nbsp; - je perioda vzorkování (tj 0,12 získat 250 bodů s časovým limitem = 30);
& Nbsp; - je počet instancí simulace;
& Nbsp; - je počet clusterů pro K-means
& Nbsp; - je prahová hodnota pro QT clustering
& Nbsp; - je počet kvantilů;
& Nbsp; - obvykle má odpovídat počtu jader Vašeho systému (tj 4 pro quad-core CPU).
Výstup
Nástroj vyrábí:
- Některé .dat (odebrány vzorky výstup simulací)
- Některé gnuplot skripty k tomu statistické rozbory
Pracujeme na komplexní uživatelské příručce

Vlastnosti :.

• Gillespie SSA algoritmus nad CWC modelů
• Hybrid stochastický / deterministické semantics
• Více instancí simulace s on-line statistiky
• Optimalizace pro vícejádrové architektury založené na rámci FastFlow
• Statistický rámec Extensible (průměr-rozptyl, filtruje shlukování atd.)
• několik ratingových sémantika (masová akce, Michaelis-Mentenové, kopec apod.)