Nejlepší Bioinformatika Pro Linux

MetagenomeDB je knihovna Pythonu navrženy tak, aby snadno ukládat, načítat a komentovat metagenomic sekvence. & Nbsp; MetagenomeDB působí jako abstrakce vrstva na vrcholu databáze MongoDB. To poskytuje API vytvářet a upravovat a spojit dva typy objektů,...

SSuMMo je knihovna funkcí navržených kolem opakované použití HMMER přiřadit sekvencí taxonů. & Nbsp; Výsledky jsou velmi komentovaných stromy vykazující druh / distribuci rod v této komunitě.Programy součástí se zdrojovým kódem jsou nástroje pro: --...

tigreBrowser je genová exprese vzor prohlížeč pro výsledky z tigre R balení (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Instalace: tigreBrowser vyžaduje Python verze> = 2.5. tigreBrowser lze nainstalovat pomocí následujícího...

MACS2 je model založený analytický nástroj pro chip-Seq dat.Se zlepšením sekvencování technik, chromatin immunoprecipitation následuje vysokou propustnost sekvenování (chip-Seq) je stále oblíbenější pro studium celogenomových protein-DNA interakce....

edittag je sbírka aplikace pro vytváření sad editačních metrických sekvence tagů, kontrola sekvenční značky pro konformaci na úpravy metriky, a integrace sekvenční značky platformě specifické sekvencování adaptérů a PCR primery. edittag se liší od jiných...

MacMolPlt je moderní grafický program pro vykreslování 3-D molekulárních struktur a normálním režimem (vibrace). Moderní...

picme je balíček Python, který obsahuje programy pro odhad a pozemek fylogenetický informativnost pro velké soubory dat. Instalace V této chvíli, nejjednodušší způsob, jak nainstalovat program je:git clone git: //github.com/faircloth-lab/picme.git / cesta...

SyntenyMiner je aplikace pro vizualizaci a vyslýchat srovnání mezi více kompletních genomu sekvencí. Rozhraní poskytuje splavné pohled zápasů se sekvencí referenčního genomu. Sekvenční utkání mezi chromozómy různých genomů mohou být dále zkoumána v rámci...

ProteinShop je interaktivní nástroj pro manipulaci s proteinové struktury. To byl navržen tak, aby rychle vytvořit sadu konfigurací proteinu pomocí lidského poznání a intuice. Tyto konfigurace mohou být podrobeny lokální nebo globální optimalizaci. Ačkoli...

PySCeS je projekt vyvinutý Triple-J skupiny pro molekulární buněčné fyziologie. & Nbsp; s cílem vyzkoušet model a pochopení složitých procesů a systémů, které tvoří živé buňky Vlastnosti :. textový popis modelu jazyk statika modul. integrátoři za...