Nejlepší Bioinformatika Pro Linux
Genepidgin je sada nástrojů, Python, které pomáhají při hodnocení a genových přiřazení názvů výrobků & nbsp; K dispozici jsou tři základní komponenty.:genepidgin * čistič *& Nbsp; standardizuje genové jména za UniProt pokynů pojmenovánígenepidgin *...
kroků je balíček pro přesné stochastické simulace systémů reakce-difuze v libovolně složitých 3D geometrie. Naším základním simulace algoritmus je implementace Gillespie je SSA, rozšířila se vypořádat s difúze molekul přes prvků 3D čtyřboká ok.I když bylo...
TRMiner je Python nástroj, který je zaměřen na vědecké údaje kurátorů. & Nbsp; Umožňuje rychle prořezávat rozsáhlé sbírky vědeckých publikací vět relevantní pro danou těžební cíl.Toho je dosaženo ve dvou krocích. Za prvé, texty jsou tranlated do...
Benchmark System Bioinformatika je pokus vybudovat přiměřenou testovací rámec, testy, a data, s cílem umožnit koncovým uživatelům a prodejcům sonda výkonnost svých systémů.Co se snažíme udělat, je vytvořit rámec pro testování, a základní sadu testů, které...
Staden Package je plně rozvinutý soubor sestavy sekvence DNA (Gap4), editaci a analytických nástrojů (Spin) pro Unix, Linux, MacOSX a MS Windows.Na Gap4 frontě došlo k několika menší spojování souvisejícízlepšení v tom, jak skóre připojí v Najít Vnitřní...
AREM je založen na MACS (model založený analýza pro chip-Seq dat).Sekvenování Vysoce výkonný spojený s chromatinu imunoterapii srážek (ChIP-Seq) je široce používán v charakterizaci genomu celé vazebné vzory transkripčními faktory, kofaktory, chromatinu...
seriesoftubes je prodloužená potrubí pro Solexa chip-násl dat.Dokumentace balení
Požadavky na :
...
MetagenomeDB je knihovna Pythonu navrženy tak, aby snadno ukládat, načítat a komentovat metagenomic sekvence. & Nbsp; MetagenomeDB působí jako abstrakce vrstva na vrcholu databáze MongoDB. To poskytuje API vytvářet a upravovat a spojit dva typy objektů,...
Seal je Python modul, který poskytuje srovnání sekvencí na Hadoop.Seal je o MapReduce aplikace pro biologickou sekvenčního. To běží na Hadoop (http://hadoop.apache.org) přes Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), což je Python MapReduce a HDFS API pro...
MISO (směs izoforem) je pravděpodobnostní framework napsaný v Pythonu, který quantitates hladinu exprese & nbsp; z alternativnímu sestřihu genů z RNA Seq dat, a identifikuje rozdílně regulované izoformy nebo exony přes vzorků.Modelováním generativní...
