Hlavní události druhé části hry se odvíjejí 200 let po skončení Klissan války - v roce 3300. Lidstvo udržuje vztahy se čtyřmi dalšími rozvinutými civilizacemi naší Galaxie: Maloqs, Pelengs, Faeyans a Gaalianové. Tentokrát nová a ještě nebezpečnější síla...