Ghemical je výpočetní chemie softwarový balíček uvolněn pod licencí GNU GPL. To znamená, že plný zdrojový kód balíčku je k dispozici, a uživatelé jsou zdarma ke studiu a upravit balíček. Ghemical je napsán v C ++.
Ghemical projekt má grafické uživatelské rozhraní (který je založen na GNOME), a to podporuje jak kvantové mechaniky (polo-empirické a ab initio) modely a molekulární mechaniky modelů (je experimentální Tripos 5,2-jako silové pole pro ekologické molecu Také nástroj pro snížení modelů proteinů [1] je v ceně. optimalizace geometrie, molekulární dynamiky a velkou sadu vizualizačních nástrojů jsou v současné době k dispozici.
Ghemical spoléhá na externím kódu, poskytovat kvantově-mechanické výpočty. Semi-empirické metody MNDO, MINDO / 3, AM1 a PM3 pocházejí z balíčku MOPAC7 (Public Domain) a jsou zahrnuty v distribuci zdroje.
Balíček MPQC (GNU GPL) se používá k poskytnutí ab initio metod: metody založené na teorii Hartree-Fock jsou v současné době podporovány bazických sadami od STO-3G na 6-31G **.
MPQC kód není zahrnuta v distribuci zdroje. Aby bylo možné použít MPQC založený AB initio metod v Ghemical, musíte nejprve zkompilovat a nainstalovat program MPQC pro váš systém, a pak sestavit Ghemical pomocí některé konkrétní nastavení, které spojují programy dohromady; naleznete v souboru INSTALL pro více informací. Ghemical také obsahuje balíček OpenBabel pro dovoz a vývoz mnoha různých formátů souborů (stejně jako další úkoly).
Instalace
Poté, co jste si stáhli nejnovější verzi, měli byste extrahovat všechny soubory ze souboru archivu pomocí "tar -zxvvf Ghemical-1.00.tgz" nebo equivalently "gunzip Ghemical-1.00.tgz; dehtu -xvvf Ghemical-1.00.tar". Poté, co že si přečtěte "Install" -file stačí extrahují získat další informace.
Co je nového v této verzi:
Komentáře nebyl nalezen