Zobrazení protein-protein a ligand-protein interakce jako grafy (sítí), kde jsou biomolekul reprezentovány jako uzly a jejich interakce jsou zastoupeny jako odkazy, je slibným přístupem pro integraci experimentální výsledky z různých zdrojů, aby bylo dosaženo systematické porozumění molekulárních mechanismů hnací fenotypu buňky. Vznik signalizačních sítí rozsáhlých poskytuje příležitost pro topologické statistickou analýzu, zatímco vizualizace těchto sítí představuje výzvu. SAVI implementuje standardní metody pro výpočet clustering, distribuci připojení a detekce, stejně jako vizualizace, síťových motivů. Kromě toho, SAVI generuje kompletní webové stránky od síťových datových souborů v textovém formátu. SAVI obsahuje nástroj s názvem PathwayGenerator. Tento nástroj vytváří spojení mapy jsou webové stránky z rozsáhlých tabulek popisující buněčné signalizaci interakce. SAVI mohou také vytvářet sítě z seznamu jmen protein / gen
Verze 2.5 mohou být blíže neurčené aktualizace, rozšíření nebo opravy chyb
Požadavky na :..
Windows (všechny)
Komentáře nebyl nalezen