Serial Cloner

Serial Cloner je molekulární biologie software. Poskytuje nástroje s intuitivním ovládáním, který vám pomůže při klonování DNA, sekvenční analýze a vizualizaci. Serial Cloner byla vyvinuta, aby lehké molekulární biologie software pro jak pro uživatele, Macintosh a Windows. Serial Cloner čte a psát DNA Stridera (tm) kompatibilních souborů a import a export souborů ve Všeobecné FASTA (stejně jako ve formátu pDRAW32). Výkonné nástroje pro grafický displej a jednoduché rozhraní pomoci analýzy a stavební kroky (adaptér, PCR, brána [tm] klonování), ve velmi intuitivním způsobem. Verze 1.3 nyní přidává virtuální fréza, webový prohlížeč s okamžitým dovoz NCBI / EMBL položky a tiché omezení mapy spolu s dalšími vylepšeními.

Co je nového v této verzi:

• [NEW] Odhaduje isoelektrickým bodem proteinových sekvencí (DNA a bílkovin sekvence Window)
• [NEW] MacOSX verze je nyní distribuována jako podepsané aplikace (Mountain Lion Gatekeeper kompatibilita)
• [doplněno] možnost v předvolbách pro výběr tabulky pK hodnotu použít pro pí odhad
• [doplněno] možnost v předvolbách použít kodonu kód z tabulky využití kodonů jako genetický kód se používá pro překlad
• [doplněno] možnost v okně restrikční mapa s pouze překládat nukleotidů, které jsou velkými písmeny
• [doplněno] tlačítka / menu zvolit konkrétní místa, který se zobrazí v Restriction mapách.
• [doplněno] Scan pro peptidové funkce v proteinových sekvencí
• [doplněno] Převzít Funkce při reverzní překladu sekvenci DNA
• [doplněno] rychlé přepínání mezi DNA a bílkovin okna Zarovnání
• [doplněno] Non formátovaný kopie proteinu sekvence (kopírovat více ... Menu)
• [doplněno] Převzít funkcí při kopírování / vkládání proteinových sekvencí
• [doplněno] Vlastnosti displeje na bílkoviny Align (Local Zarovnání)
• [doplněno] přepínací tlačítko pro zvýraznění rozdílů ve vyrovnaných proteinech
• [doplněno] zkratka (S) pro rychlé zobrazení nebo maska ​​funkce (na kartě Funkce sekvence Windows)
• [doplněno] "Anchor" a domény "jádra" primerů jsou nyní uznávány jako funkce v pořadí Windows
• [doplněno] tlačítko pro rychlý výběr plný lineární vložku v okně "Postavit Construct"
• [doplněno] Přidáno zástupce "Kopírovat Non naformátován" [Command-Shift-K]
• [doplněno] Položka menu pro přechod na Serial Cloner fóra
• [doplněno] Položka menu pro přechod na Serial Cloner kanálu YouTube (výukový program)
• [AKTUALIZOVÁNO] Nyní je možné zcela změnit velikost oken sekvenční
• [AKTUALIZOVÁNO] Chybějící místa jsou uvedeny kurzívou v enzymových CHOOSER oknech (grafické a omezování Maps)
• [AKTUALIZOVÁNO] Unikátní lokality jsou vyznačeny tučně enzymů CHOOSER oknech (grafické a omezování Maps)
• [AKTUALIZOVÁNO] analýze z NCBI sekvencí (Web Access), aby se ve změnách účtu na stránkách NCBI.
• [AKTUALIZOVÁNO] Vylepšené parsování sekvence obsahující "X" v sekvenci nukleotidů
• [AKTUALIZOVÁNO] Changed zkratka z "zkopírovat všechny sekvencí Multifasta" na [Command-Shift-J] namísto [Command-Shift-K]
• [OPRAVOVANÉ] určených pro Windows interface chyba okno "dovozní kodonu systematické chyby"
• [OPRAVOVANÉ] chyba někdy brání řádnému kopie obrazů (Graphic mapa, Virtual Cut, shRNA) do schránky (specifické Windows)
• [OPRAVOVANÉ] obtíže vyplývající s netradičními RE jmény jako R1.BceSIV v konkrétním enzymem "Chooser grafické mapy.
• [OPRAVOVANÉ] Problém [Brána Klonování] s uvedením Funkce když cíl vektor byl antisense (att2-att1 směr)
• [OPRAVOVANÉ] chyba při výběru nejpoužívanějších AA při reverzní překlady
• [OPRAVOVANÉ] Problém s "Vybrat vše" v pořadí a bílkovin okna
• [OPRAVOVANÉ] Typ souboru problém spojený s Serial Cloner souborů (lámání kompatibilitu s Sequencher dovozem zejména)
• [OPRAVOVANÉ] ligace: Někdy se zbytečně vyrábí zvrhlík DNA
• [OPRAVOVANÉ] Brána: generované DNA, ale pak, když pak uložen jako neznámého typu
• [OPRAVOVANÉ] PCR:. Provádí-li se na "neznámý formát" sekvence, nesprávně vytvořené "bílkoviny" typu
• [OPRAVOVANÉ] Problém aktualizaci prvek při anulování změnu
• [OPRAVOVANÉ] Při vkládání proteinové sekvence ve formátu GenBank (NCBI) okno sekvence protein je nyní správně vytvořen.
• [OPRAVOVANÉ] problém s BLAST serverem NCBI při použití ne-ASCII znaky v pořadí jmen
• [OPRAVOVANÉ] Problém s displejem Feature po cyklu, kdy byl nalezen pouze jeden Feature
• [OPRAVOVANÉ] vzácný problém zobrazení funkce v okně Construct
• [OPRAVOVANÉ] refresh problém při použití velikost znaků odlišný od 12 bodů v grafických map.
• [OPRAVOVANÉ] chybu v restrikční mapa okna, kde první řádek překladu aminokyselin byl posunut v režimu kodonů
• [OPRAVOVANÉ] chyba týkající se zamezení používání dříve vybraných enzymů ve virtuálním Cutter okna