FlexS předpovídá konformaci a orientaci jednoho z ligandů vzhledem k druhé. V FlexS se předpokládá, že referenční-ligand být tuhý, měl by tedy být v konformaci, která je podobná vázaného stavu. Superpozice algoritmus FlexS vyžaduje jen málo manuální zásah. Můžete integrovat tyto znalosti do výpočtů s FlexS prováděním jednotlivé kroky ručně. Tak, FlexS je určen pro interaktivní práci na ligandu páry, jakož i pro ligand na bázi virtuální screening. Dvě hlavní aplikace FlexS jsou ligand Super polohování (např. Pro CoMFA / QSAR) a virtuální screening. Máte-protein a malé molekuly vazbu na něj (tzv reference-ligand), ale bez struktury proteinu, můžete si vzít referenční strukturu jako negativní otisk aktivního místa. FlexS určuje podobnost mezi zkouškou a referenční stavby tím, že vyrovnání. V virtuální screening, máte referenční-ligand a sadu sloučenin, a máte-li zájem o stanovení priorit sloučenin pro experimentální testování.
Komentáře nebyl nalezen