MacMolPlt

MacMolPlt je chemie vizualizační nástroj, který může být použit k vytvoření molekul s integrovaným grafickým modelu plnidla, vytvořit vstupní soubory pro GAMESS výpočetní chemie programu, a pak vizualizaci výsledků výpočetních chemických sérií. Funkce zahrnují 3D vysoce kvalitní zobrazení, animace normálním režimem a reakčních sekvencí a výstup do různých formátů, včetně vysoce kvalitních snímků a QuickTime a Flash filmy.

• Input použití:
• Formát MolPlt souboru proražen by GAMESS
• vložením v pravoúhlých souřadnic z jakékoli GAMESS nebo Gaussian log soubor
• jakýkoliv GAMESS vstup, přihlaste se nebo IRC file
• Xmol stylu XYZ soubor
• Molden soubory ve formátu
• Protein Data Bank (PDB ) souboru
• Chemical Markup Language (CML) soubory
• Build graficky s interaktivním molekul editor
• Build ručně pomocí pravoúhlých nebo Z-Matrix stylu vnitřní souřadnice
• 3D zobrazení struktury a normálním režimu
• Animace normálním režimem.
• 3D real-time otáčení a překlad pod kontrolou myši
• Výpočet všech parametrů Z-matice
• Vizuálně opatření / zobrazení vzdálenosti, úhly a dihedrals.
• automatizované vytváření lineárních nejméně Motion (LLM) cesty
• 2D a 3D výpočet a zobrazení:
• Molekulové orbitaly (AO, MO, anebo SSTP pánské)
• Total Electron o hustotě
• Hustota rozdíly
• Molekulární elektrostatické potenciály (MEPMaps)
• Základní vstupní soubor generátor pro GAMESS
• OpenGL používá pro vysoce kvalitní 3D vykreslování
• Podpora pro molekulární symetrie
• Generování symetrie závislé atomy
• Zjistěte, symetrie unikátních atomů
• automaticky určí seznam podporovaných skupin bodů za sadu souřadnic.
• Otočit souřadnic do principu správné orientaci
• operátory Display symetrie pro mnoho skupin bodů
• Kvalita Publikace výstup (barevné nebo černobílé) prostřednictvím přímý tisk nebo zkopírujte a vložte do jiné aplikace.
• Výkon v různých formách, včetně Windows BMP, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, flash filmy a QuickTime.

Co je nového v této verzi:

několik vylepšení byly provedeny v zobrazení kódu. Volby byly přidány do 3D podokně prefernces pro hladké tónem a bez stínů.
Přidána elementární podporu MOPAC soubory.
Přidána možnost přepínání viditelnosti ab initio, MM, a EŠV atomy.
Vylepšená podpora pro modelové základních potenciálů.
Přidáno hák do vstupního Builder pro nový GAMESSQ programu.
Lepší PNR souboru analyzátoru.