QMForge projekt může být použit k analyzovat výsledky kvantové chemie (DFT) výpočty. Gaussian 98/03, ADF, GAMESS (USA), GAMESS (UK), PC-GAMESS, Jaguar, a ORCA soubory jsou podporovány (viz níže). V následujících analýzách jsou k dispozici:
· Mulliken populační analýza (MPA)
· C-kvadrát analýza populace (SCPA)
· Překrývání populační analýza (OPA)
· Bond Objednávky Mayera
· Charge Analýza rozkladu (CDA)
· Analýza Fragment
MPA, CSPA, a OPA vyžadují uživatelsky definované sady fragmentů, a vytiskne procento příspěvků tyto fragmenty dělají ke každému molekulární okružní v molekule. Dluhopisů objednávky Mayer vypočítává dluhopisů objednávky mezi každým párem atomů v molekule. CDA a Fragment analýza vyžadují tři nebo více výpočtů (jeden pro celou molekulu, a dva fragmentové výpočty), a poskytovat informace o vazebných interakcí mezi fragmenty.
QMForge je přímým potomkem PyMOlyze, který byl inspirován konzole bázi, (původně) Windows-jediný program AOMix, který má funkce, včetně (a kromě) uvedených výše. Původně jsem napsal PyMOlyze, protože jsem chtěl (grafické tj.), Program udělat MPA pro každý molekulární okružní z Gaussova výpočtů uživatelsky příjemný Linux. I rozšířil pracovat se soubory z geometrie optimalizace, protože jsem zjistil, přála si, abych mohl přeložit a otočit optimalizovanou strukturu a kromě toho, že jako soubor XYZ. Nyní, to byl přejmenován QMForge, a já ji použít pro téměř všechno kromě dělat molekulární orbitální obrázky a diagramy.
Stále existují některé analýzy, které QMForge nedělá, takže pokud to neřeší vašim potřebám, check out AOMix (nebo střílet mi e-mail a budeme mluvit).
QMForge byl vytvořen pomocí skriptovacího jazyka Python, se qt4 toolkit a jeho python rozšíření PyQt4, numerický, a cclib compuational balíček rozebrat knihovnu. To byl testován na systému Windows XP, Windows 2000 a Mac OS X; to by mělo fungovat stejně dobře na jakémkoliv distribucí GNU / Linuxu, i když jsem nebyl testován to ještě.
Co je nového v této verzi:
· Změna názvu na QMForge
· Podpora ORCA
· Přepnout do Numpy 1.0.2 a 2.1.1 openbabel
· Používá cclib postavený z 0,8 větve + nevydané ORCA parseru
Komentáře nebyl nalezen