Top Bioinformatika Pro Linux
OpenElectrophy je rámec, který usnadní manipulaci, skladování a analýzu elektrofyziologických dat. Je možné importovat data z mnoha různých formátů souborů a uložit je do jedné databáze SQL typu.Nástroje analýzy uvedená v OpenELectrophy jsou detekce...
rašelina je sada programů pro zachycení, předvídání a analyzování biofyzikální vlastnosti bílkovin.Viz http://enzyme.ucd.ie/PEAT pro dokumentaci, návody, screenshoty apod Požadavky na :. ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) je účinný program, který vyrovnává relativně krátké nukleotidové sekvence proti dlouhé referenční sekvencí, jako je například lidského genomu.Software implementuje dva algoritmy, Bwa-krátký a BWA-SW. Dřívější práce pro dotaz...
SSuMMo je knihovna funkcí navržených kolem opakované použití HMMER přiřadit sekvencí taxonů. & Nbsp; Výsledky jsou velmi komentovaných stromy vykazující druh / distribuci rod v této komunitě.Programy součástí se zdrojovým kódem jsou nástroje pro: --...
přehlédnutí je Python API pro čtení binárních datových souborů vytvořených pomocí rámce pro správu dat Goby next-gen.Za normálních okolností, tento adresář je jako součást kompletního Goby balíček, k dispozici od:& Nbsp; http:...
PySCeS je projekt vyvinutý Triple-J skupiny pro molekulární buněčné fyziologie. & Nbsp; s cílem vyzkoušet model a pochopení složitých procesů a systémů, které tvoří živé buňky Vlastnosti :. textový popis modelu jazyk statika modul. integrátoři za...
Pysam je Python modul pro čtení a manipulaci Samfiles. & Nbsp; Je to lehký obal z samtools C-API.Stručný návod k obsluze je zde. Podrobnější dokumentace je k dispozici zde.Dotazy a připomínky jsou velmi vítány a měly by být zaslány do skupiny uživatelů...
TRMiner je Python nástroj, který je zaměřen na vědecké údaje kurátorů. & Nbsp; Umožňuje rychle prořezávat rozsáhlé sbírky vědeckých publikací vět relevantní pro danou těžební cíl.Toho je dosaženo ve dvou krocích. Za prvé, texty jsou tranlated do...
Seal je Python modul, který poskytuje srovnání sekvencí na Hadoop.Seal je o MapReduce aplikace pro biologickou sekvenčního. To běží na Hadoop (http://hadoop.apache.org) přes Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), což je Python MapReduce a HDFS API pro...
avalanchetoolbox je sada nástrojů pro identifikaci a popis větvení procesů, jako jsou neuronové lavin Požadavky na :. ...
