Top Bioinformatika Pro Linux

AHREA je sofware sada, která umožňuje vyhledávání relativní výraz studujících snadné. . Je napsán v Pythonu Požadavky na : ...

AREM je založen na MACS (model založený analýza pro chip-Seq dat).Sekvenování Vysoce výkonný spojený s chromatinu imunoterapii srážek (ChIP-Seq) je široce používán v charakterizaci genomu celé vazebné vzory transkripčními faktory, kofaktory, chromatinu...

CWC Simulator je C ++ implementace CWC, se kalkulu pro reprezentaci a simulace biologických systémů. & Nbsp; Po úspěšné instalaci (viz instalace), budete moci spouštět simulace přes CWC modelů, jak je uvedeno v některých příkladech (viz příklady /)....

Syntainia je inovativní aplikace pro vizualizaci více genomů. & Nbsp; to představuje jednoduché a intuitivní uživatelské rozhraní pro zobrazení a manipulovat vztahy mezi skupinami genů. S jasnější vizualizaci genu, je to jednodušší pro výzkumníka...

checkmyclones je software, který poskytuje nástroje pro kontrolu Sanger výsledky sekvenování. & Nbsp; (nebo jakýkoli plain-text nebo FASTQ soubory) proti sady referenčních sekvencí, pokud v nějakém rozumném formátu (včetně souřadnic) Požadavky na : ...

tigreBrowser je genová exprese vzor prohlížeč pro výsledky z tigre R balení (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Instalace: tigreBrowser vyžaduje Python verze> = 2.5. tigreBrowser lze nainstalovat pomocí následujícího...

picme je balíček Python, který obsahuje programy pro odhad a pozemek fylogenetický informativnost pro velké soubory dat. Instalace V této chvíli, nejjednodušší způsob, jak nainstalovat program je:git clone git: //github.com/faircloth-lab/picme.git / cesta...

tapír je nástroj, Python, který obsahuje programy pro odhad a pozemek fylogenetický informativnost pro velké soubory dat. pochvalná tapír Při použití tapír, prosím citovat:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapír umožňuje vysokou propustnost analýzu...

kroků je balíček pro přesné stochastické simulace systémů reakce-difuze v libovolně složitých 3D geometrie. Naším základním simulace algoritmus je implementace Gillespie je SSA, rozšířila se vypořádat s difúze molekul přes prvků 3D čtyřboká ok.I když bylo...

NEO (Neural Ensemble Objects), a je to projekt poskytnout společný soubor základních tříd pro použití v nervové analýze dat, s cílem dostat OpenElectrophy, NeuroTools a možná dalších projektů s více blízko podobnými cíli dohromady.Dva hlavní cíle byly...