compsort

nástroj příkazového řádku pro porovnání čárkou datových souborů pomocí relativní rozdíly určit nejvíce podobné konformace. Compsort porovnává soubory dat pomocí relativní rozdíl, počítá skóre podobnosti, seřadí skóre ve vzestupném pořadí (nižší hodnoty představují větší podobnost), šetří X počet nízké skóre.
Datové soubory vytvořené uživatelem, musí být odděleny čárkou textové soubory. Každý soubor představuje unikátní molekulu. Každý řádek v souboru představuje jedinečný konformaci molekuly. První sloupec v souboru dat musí být štítek jedinečné konformaci reprezentované řádku. Zbytek sloupců jsou číselné popisovače, jako je například měření vzdálenosti prostor.
Řádky jsou porovnány combinatorially mezi soubory. Popisky v porovnání se zřetězeny a uloží se skóre pro sadu řádků. To poskytuje způsob, jak identifikovat konformace, které produkují dané skóre podobnosti.

Budoucí práce zahrnuje:

• přidávání GUI rozhraní
• vysílání papír na mém 3D farmakofor modelování algoritmu
• paralelní verze využívající MPI

Co je nového v této verzi:

• pevná pár menší upozornění kompilátoru
  
• přidané hlášení času výpočtu pro sadu kombinatorických výpočtů navíc k již dříve hlášený čas druhu
  
• zvýšená optimalizace kompilátoru úroveň binárního

Požadavky na :

Mac OS X 10.3