Nový Bioinformatika Pro Linux

kroků je balíček pro přesné stochastické simulace systémů reakce-difuze v libovolně složitých 3D geometrie. Naším základním simulace algoritmus je implementace Gillespie je SSA, rozšířila se vypořádat s difúze molekul přes prvků 3D čtyřboká ok.I když bylo...

NEO (Neural Ensemble Objects), a je to projekt poskytnout společný soubor základních tříd pro použití v nervové analýze dat, s cílem dostat OpenElectrophy, NeuroTools a možná dalších projektů s více blízko podobnými cíli dohromady.Dva hlavní cíle byly...

OpenElectrophy je rámec, který usnadní manipulaci, skladování a analýzu elektrofyziologických dat. Je možné importovat data z mnoha různých formátů souborů a uložit je do jedné databáze SQL typu.Nástroje analýzy uvedená v OpenELectrophy jsou detekce...

rašelina je sada programů pro zachycení, předvídání a analyzování biofyzikální vlastnosti bílkovin.Viz http://enzyme.ucd.ie/PEAT pro dokumentaci, návody, screenshoty apod Požadavky na :. ...

Burrows-Wheeler Aligner (BWA) je účinný program, který vyrovnává relativně krátké nukleotidové sekvence proti dlouhé referenční sekvencí, jako je například lidského genomu.Software implementuje dva algoritmy, Bwa-krátký a BWA-SW. Dřívější práce pro dotaz...

SSuMMo je knihovna funkcí navržených kolem opakované použití HMMER přiřadit sekvencí taxonů. & Nbsp; Výsledky jsou velmi komentovaných stromy vykazující druh / distribuci rod v této komunitě.Programy součástí se zdrojovým kódem jsou nástroje pro: --...

přehlédnutí je Python API pro čtení binárních datových souborů vytvořených pomocí rámce pro správu dat Goby next-gen.Za normálních okolností, tento adresář je jako součást kompletního Goby balíček, k dispozici od:& Nbsp; http:...

PySCeS je projekt vyvinutý Triple-J skupiny pro molekulární buněčné fyziologie. & Nbsp; s cílem vyzkoušet model a pochopení složitých procesů a systémů, které tvoří živé buňky Vlastnosti :. textový popis modelu jazyk statika modul. integrátoři za...

Pysam je Python modul pro čtení a manipulaci Samfiles. & Nbsp; Je to lehký obal z samtools C-API.Stručný návod k obsluze je zde. Podrobnější dokumentace je k dispozici zde.Dotazy a připomínky jsou velmi vítány a měly by být zaslány do skupiny uživatelů...

TRMiner je Python nástroj, který je zaměřen na vědecké údaje kurátorů. & Nbsp; Umožňuje rychle prořezávat rozsáhlé sbírky vědeckých publikací vět relevantní pro danou těžební cíl.Toho je dosaženo ve dvou krocích. Za prvé, texty jsou tranlated do...