CLC DNA Workbench

CLC DNA Workbench vytváří prostředí software umožňuje uživatelům, aby se velké množství pokročilých sekvence DNA analýz, v kombinaci s hladkým správu dat, a vynikající grafické zobrazení a možností výstupu.
CLC DNA Workbench je k dispozici pro Windows, Mac OS X a Linux platformy

Vlastnosti :.

• Bioinformatika je k dispozici v Gene Workbench :
• Flexibilní zobrazování kruhových molekul.
• Editor pro graficky a algoritmicky pokročilé primerů designu
• Montáž sekvence DNA údajů
• Molekulární klonování
• Automatická SNP anotaci sekvencí
• Search a objev DNA vzorů
• Místní složitost region analýzy
• zpětný překlad z proteinu do genu, na základě překladových tabulek z celé řady živočišných druhů,
• Upřesnit Analýza a řízení restrikčních enzymů
• bodovém grafu analýzy založené
• statistika krátká forma DNA, včetně řady charakteristik dané molekuly
• NCBI vyhledávání sekvence dat
• Přístup na web info od PubMed
• Ostatní Bioinformatika vlastnosti:
• DNA, RNA a proteinová sekvence editor zobrazování lineární i kruhové molekuly,
• DNA, RNA, a zarovnání protein editor
• Interaktivní loga podél obou DNA, RNA a proteinové zarovnání
• Dávkové zpracování analýz na více sekvencí v jednom pracovním kroku
• Motif vyhledávání
• Pattern objev (neznámé vzory)

Možnost zarovnání
• Advanced re-vyrovnání a fix-bod
• Sequence logo grafy podél DNA, RNA a proteinové seřazení
• Manuální anotace sekvencí
• Integrovaný PubMed vyhledá
• Web-based sekvence hledání pomocí BLAST
• bodovém grafu analýzy založené
• Místní složitost oblast analýzy a složitost pozemky
• grafy frakce Gap
• G / C analýza obsahu a grafy
• Projekt a správa dat:
• Plná integrace vstupních dat, správu dat, výsledků výpočtů, a export dat
• Detailní log historie
• Všechny typy souborů mohou být uloženy v místních projektech, a vypustil z programu
• Import a export dat ve velkém množství formátů souborů
• Možnost pracovat v několika účinných pracovních prostorů najednou, což umožňuje současnou práci na více projektech
• Importovat stopových datových souborů a skóre kvality z automatizovaných sequening stroje DNA využívající standard Chromatogram formát, formáty ABI a formát PHD (Phred)
• Sledování a podávání zpráv:
• Advanced pohled BLAST

Zobrazit
• Pokročilá grafy
• Advanced pohled histogram
• Advanced pohled dot plot
• Vyhledávání charakteristiky v sekvencích a angažovaností

Požadavky na :

• 256 MB RAM požadováno
• 512 MB RAM doporučeno
• 1024 x 768 displej doporučuje

Omezení :

• 4-týdenní plně funkční demo